Awesome Health – 优质医疗领域AI开源项目清单

Awesome Health 是一份 GitHub 的一份高质量的医疗领域开源项目清单。覆盖了各个方面，从电子病历系统到医学影像处理，从远程医疗到机器学习，每个项目都经过精心筛选。适合医疗软件开发者、医院 IT 人员和医疗研究人员，可以快速找到所需的开源解决方案。

J.Cling 推荐拓展：

MedRAX – 医学影像智能体｜AI智能分析胸部X光片

主要功能特点

电子病历系统（EHR）：包含 OpenMRS、Bahmni、HospitalRun 等 20+ 个开源系统；
医学影像处理：涵盖 DICOM 服务器、图像查看器、3D 可视化等工具；
开发框架和库：提供 FHIR、HL7 等标准的实现库，支持多种编程语言；
医疗数据标准：整理了 FHIR、HL7、DICOM 等核心标准规范；
机器学习工具：收录专门用于医疗健康的 AI 工具和数据集；
医疗物流管理：包含供应链、资产管理等实用系统。

官方使用说明

电子健康记录

Akello – 集成心理健康基础设施
Bahmni – 电子病历和医院系统。
Cottage Med – 由医生设计的电子病历软件。
GNU Health – 电子病历、医院管理、和健康信息系统。
GNUmed – 电子病历软件。
EHRBase OpenEHR 临床数据存储库。
EHRServer – CaboLabs EHRServer。
ERPNext – 帮助管理患者、预约、咨询、实验室检查和账单的模块。
FreeMedForms EMR – 电子病历软件。
HospitalRun – 帮助在最缺乏资源的地区提供最现代化的医院信息系统。
HOSxP – 泰国医院信息系统，旨在简化卫生中心和中央医院的医疗工作流程。
LibreHealth EHR – 以临床为重点的电子健康记录系统。
MedinTux – 法国医疗实践管理系统。
Medplum – 支持灵活快速开发医疗应用的开发平台。
Odoo Medical – 通用健康与医院信息系统。
OpenClinic – 医疗记录系统。
OpenEMR – 电子健康记录和医疗实践管理应用程序。
OpenEyes – 眼科电子病历应用程序。
Open Hospital – 为贫困农村医院设计的电子病历软件。
openMAXIMS – 为 NHS 设计的完整患者管理系统。
OpenMRS – 企业级电子病历系统平台。
OSCAR EMR – OSCAR 麦克马斯特项目。
Ozone HIS – 基于 OpenMRS 3 构建的企业级集成健康信息系统。
Ripple – 由 NHS 资助、社区主导的倡议，致力于构建集成数字护理记录平台。

规格

连续性护理文档 – 连续性护理文档规格
DICOM 标准浏览器 – 提供了一种有效学习 DICOM 标准并检查 DICOM 属性的方式。
FHIR – 快速健康互操作性资源。
HL7 版本 2 – 所有版本 HL7v2 的规范
OHDSI OMOP 共享数据模型 – 标准化数据模型，涵盖许多医疗概念，Github 上有很好的存在感，包括许多主要关系型数据库的脚本。
OpenEHR – 软件可以基于其构建的开规范。
Open mHealth – 移动健康数据开放标准。
SMART on FHIR – 基于开放标准的技术平台。

处方

OpenEP – 一套改进处方和药品管理安全性与效率的药品管理应用程序。

护理

open-eObs – 观察和临床评估平台，提供对病房内所有患者的实时视图。

成像

3D Slicer – 跨平台应用程序，用于分析、可视化和理解医学图像数据。
Cornerstone – 开源项目，旨在提供完整的基于网络的医学成像平台。
dcm4che – 临床图像和对象管理系统。
Dicoogle – Dicoogle 是一个可扩展、平台无关且开源的 PACS 系统。
Drishti – 适用于科学家和普通人的断层扫描和电子显微镜数据可视化工具。
DICOMcloud – 一个独立的 DICOMweb 服务器，实现了 DICOMweb/WADO 服务的 RESTful 接口。
DICOM Server – DICOMweb 标准的开源实现。
DICOM Web Viewer – 基于 JavaScript/HTML5 的 DICOM 查看器，具备标准工具，并专注于支持各种屏幕尺寸。
Fiji – 生物图像分析的开放源平台。
Horos – 医学图像查看器。
InVesalius – 用于计算机断层扫描和磁共振图像重建的开源软件。
ITK – 用于开发具有前沿算法的二维和三维图像分割和配准程序的工具包。
ITK-SNAP – 用于三维图像导航、注释和自动分割的交互式软件，注重用户友好性。
LibreHealth Radiology – 为放射学和成像专业人员定制的 LibreHealth 工具包版本，增加了额外的工具。
Kaapana – 医疗数据分析领域的开源工具包，用于实现最先进的平台配置。
Kheops – 开源平台，用于共享医疗图像
OHIF – OHIF 零占用 DICOM 查看器和肿瘤学特定病灶跟踪器。
Omero – 用 Java 编写的开源客户端/服务器系统，用于可视化、管理和注释显微镜图像和元数据。
OpenREM – 为物理学家提供的辐射暴露监测工具。
OpenSlide – 是一个用于读取全切片图像文件的 C 库。
Orthanc – 轻量级 DICOM 服务器，适用于医疗保健和医学研究。
Papaya – 纯 JavaScript 医学研究图像查看器。
Slim – 可互操作的病理计算网络查看器和注释工具。
Viv – 在网络上对高分辨率多重生物成像数据进行多尺度可视化。
VTK – 支持多种算法和建模技术的三维可视化工具包。

Dental

Open Dental – 牙科诊所管理软件。
OpenMolar – 牙科诊所管理软件。

实验室

OpenELIS – 全球健康实验室信息系统。
SENAITE – 实验室信息管理系统。

框架

API Server – 支持面向患者和临床医生的应用的 FHIR 服务器。
Blaze – 带有内部快速 CQL 评估引擎的 FHIR 存储。
CareKit – 开源软件框架，用于创建帮助人们更好地理解和管理健康的应用程序。
Clinical Meteor project – 适用于 FDA、HIPAA 和 HL7 合规应用程序的 Meteor 项目。
Clinical Quality Language – 临床质量语言是 HL7 标准，用于表达临床知识。
CyclOps – 医疗机器学习实现的框架。
FHIRBase – 基于 FHIR 标准的存储。
FHIR Proxy – 作为中介在 FHIR 数据与 Azure API 之间传输的安全应用程序。
FHIR Works on AWS – AWS 上的 FHIR Works 部署。
FHIR Server for Azure – FHIR 标准的.NET Core 实现。
Inferno – 提供 FHIR 的测试工具
干预引擎 FHIR 服务器 – GoLang 中的通用 FHIR 服务器实现。
LinuxForHealth FHIR Server – HL7 FHIR 规范版本 4 的模块化 Java 实现。
Medblocks UI – 用于快速开发 openEHR 和 FHIR 系统的 Web 组件。
Opal – 用于构建临床应用的框架。
ResearchKit – 软件框架，可轻松创建用于医学研究或其他研究项目的应用程序。
Spark – 以 C#开发的公共领域 FHIR 服务器。
Sushi – FHIR 的参考实现命令行解释器/编译器。
Swift-SMART – 用于 iOS 和 OS X 的 Swift SMART on FHIR 框架。

库

Android FHIR SDK – Android FHIR SDK
Archie – Java 编写的 OpenEHR 库。
Asymmetrik FHIR API Server – HL7 FHIR 规范的 REST 安全实现。
Datamol – 让分子操作变得简单。基于 RDKit 构建的轻量级 Python 包装器。
DCMTK – DICOM 工具包。
dicom – GoLang 中的高性能 DICOM 医学图像解析器。
ehrapy – Python 中的电子健康记录分析工具。
Evil-DICOM – C# DICOM 库。
Fellow Oak DICOM – .NET、.NET Core、通用 Windows、Android、iOS、Mono 和 Unity 的 DICOM。
FHIRKit Client – Node FHIR 客户端库。
FHIRModels – FHIRModels 是一个用于 FHIR 资源数据模型的 Swift 库。
FHIR .NET API – HL7 FHIR 的官方 .NET API。
fhir.js – FHIR 的 JavaScript 客户端。
FHIR 协议缓冲区 – Google 为 FHIR 实现的协议缓冲区。
Graphir – FHIR API 的 GraphQL 接口
HAPI FHIR – 用于 HL7 FHIR 客户端和服务器的 Java API。
Hearth – 一个快速符合 FHIR 标准的纵向数据存储服务器。
Health data standards – 用于生成和消费各种医疗相关格式的 Ruby 库。这些包括 HITSP C32、QRDA 类别 I 和 QRDA 类别 III。
Hermes – 一个 SNOMED CT 术语服务器。
Metriport – 开源通用医疗数据 API。
MITK – 医学影像交互工具包。
nhs-numbers – 提供 NHS 号码相关工具的 Python 包，包括有效性检查、标准化和生成。
Node HL7 – 与 Java Hapi HL7 库桥接的 Node 模块。
Node-hl7-parser – Redox 的 HL7 v2 到 schema 化 JSON 解析器的开源版本。
php-fhir – 用于从 HL7 FHIR 规范创建 PHP 类的工具。
pynetdicom – DICOM 网络协议的 Python 实现。
Python HL7 – 用于将 HL7 版本 2.x 的消息解析为 Python 对象的简单库。
Python SMART on FHIR 客户端 – 支持 SMART on FHIR 协议的灵活 Python 客户端，用于 FHIR 服务器。
Python 835 解析器 – 用于 EDI 835 医疗费用支付和付款通知文件的简单易用 Python 接口。
Ruby FHIR – Ruby 中的 FHIR 客户端实现。
Ruby HL7 – Ruby HL7 库。
Rust FHIR – HL7 FHIR 的 Rust SDK
TorchXRayVision – 用于胸部 X 光数据集和模型的库。包含预训练模型。